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ThruPLEX Plasma-seq Kit,血浆cfDNA文库

  • 型   号:Rubicon R400491
  • 价   格:31533

ThruPLEX Plasma-seq Kit,血浆cfDNA文库构建试剂优化了模版修复和文库合成步骤,用于血浆游离DNA(cell-free,cfDNA)的illumina文库构建。适用肿瘤(ctDNA循环肿瘤DNA)及产前无创检测(母体血浆中胎儿游离DNA分析)所需WGS、WES和靶向测序。

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华雅旗下红荣微再授权代理TAKARA Rubicon 文库构建(illumina平台)产品

 

 

Rubicon ThruPLEX® Plasma-seq Kit

ThruPLEX与所有Illumina平台兼容

产品英文名称:ThruPLEX® Plasma-seq Kit

产品中文名称:血浆来源cell free DNA NGS文库构建试剂

样本:血浆来源的cfDNA(cell free DNA)和ctDNA(循环肿瘤DNA)

用途:WGS,WES,靶向测序,ctDNA分析

 

ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技术,并用于血浆来源cfDNA高品质NGS文库(illumina平台)构建。

该试剂专门针对cell-free DNA进行优化,在保持样本GC代表性的基础上,提升了文库的信息容量。文库构建后可用于CNV分析、全基因组测序分析或是采用一些panel针对目标区域进行捕获富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。

血浆样品采用ThruPLEX Plasma-seq试剂盒制备文库,能有更好的灵敏度、更准确的基因变异分析结果。与其它液体活检的样品一样,血浆由于其易获得、价值高的特点,深受研究肿瘤学或者孕妇血浆中胎儿游离DNA科研工作者的重视。

 

产品特点

专为cfDNA设计:修复及连接试剂配方更新,方法优化

高品质NGS文库:在宽广的GC含量范围内,可以达到高检测再现性

起始量范围广:<1 ng30 ng cfDNA

快速简便:单管、2小时、3步操作步骤,无需纯化或样品转移步骤

应用领域:液体活检、ctDNA、靶向测序等领域文库构建

兼容自动化平台:Beckman® FXP Workstation

 

ThruPLEX与所有Illumina平台兼容

Designed for cell-free DNA: newly formulated repair and ligation reagents with optimized protocols

High performance NGS libraries: high diversity with broad and reproducible GC coverage

Variable sample input: <1 ng to 30 ng of cell-free DNA

Fast and simple workflow: 3 steps in a single tube or well in 2 hours with no purification or sample transfer steps

Research applications: libraries from samples where results require high sensitivity including liquid biopsies, ctDNA, and targeted sequencing

Automation-friendly: Beckman® FXP Workstation

 

产品应用

WGS,WES,靶向测序,ctDNA分析

cfDNA文库构建,肿瘤及产前无创检测(母体血浆中胎儿游离DNA分析)

ThruPLEX Plasma-seq 优化用于cell-free DNA等液体活检样品

液体活检样品包括

循环核酸

– Cell-free DNA (cfDNA)

• 循环肿瘤DNA(ctDNA)占一小部分

及RNA 外泌体等

 

ThruPLEX技术原理

ThruPLEX技术和所有Illumina NGS平台兼容。

技术要点:茎环形接头

茎环形接头的特别设计,免去了大多数Illumina等文库制备技术需要的中间纯化和样品转移步骤。整个实验只需15分钟手动操作且为1个反应管、2个小时、3步反应的简单过程。仅在PCR反应后进行1次磁珠纯化,纯化造成的样品损失低,可对珍贵样品进行有效分析。

 

产品使用

适用样本:液体活检样本

1ng-30ng 血浆、尿液来源的cfDNA

 

组份 

分模板准备、文库合成和文库扩增三大部分。保存-20℃。

Template Preparation Buffer 模板准备缓冲液(红色)

Template Preparation Enzyme 模板准备酶(红色)

Library Synthesis Buffer文库合成缓冲液(黄色)

Library Synthesis Enzyme文库合成酶(黄色)

Library Amplification Buffer文库扩增缓冲液(绿色)

Library Amplification Enzyme文库扩增酶(绿色)

Nuclease-Free water 无核酸酶水(无色)

Indexing 试剂(蓝色)

咨询 1500 1904 520 红荣微再-客服: 经销商专员

自备材料:

PCR管或96PCR板和密封件

Low binding aerosol barrier tips

新鲜制备的80%(v / v)乙醇

Agencourt® AMPure® XP 磁珠Beckman Coulter,目录号A63880

 

可选试剂:

KAPA®Library Quantification Kit – Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)

EvaGreen® Dye (20X in water, Biotium, CAT. NO. 31000-T)

Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories

 

简单的工作流程:一管反应

 

样品加入PCR管。

准备模版修复混合液1(红盖),加入PCR管,反应。

准备文库合成混合液2(黄盖),加入PCR管,反应。

准备文库扩增混合液3(绿盖),加入PCR管,反应。

 

产品性能

 

cell-free DNA文库多样性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit构建的文库,具有高的多样性和低的duplicatesunmapped reads。图中表示cfDNA分别提取于3份血浆样品,文库定量采用Qubit荧光定量。Bioanalyzer测定mononucleosomal DNA在各样品的量分别为0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式测序,且每个文库产生17 M25 M reads。每个文库在down-sampling数据至17 M reads以后,计算Duplication rates

 

Rubicon R400490/R400491/R400492 订购信息

 

货号

名称

规格

价格

R400490

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit

12 Rxns

¥9109

R400491

ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit

48 Rxns

¥31533

R400492

ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit

96 Rxns

¥56760

 

Rubicon公司成立于2000年,总部位于美国密歇根州。产品都拥有技术,检控严格,拥有cGMP级生产能力,是单细胞测序文库构建的。2017年1月,Rubicon 成为Takara的一员,并且发展良好。

华雅再生医学旗舰公司:红荣微再(上海)生物工程技术有限公司主营细胞治疗和精准医疗等产品,2018年与TAKARA继续合作,授权代理(上海)其旗下Rubicon单细胞文库构建试剂等产品。

 

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