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QIAGEN REPLI-g Mini Kit 全基因组扩增试剂

  • 型   号:150023
  • 价   格:

QIAGEN REPLI-g Mini Kit 全基因组扩增试剂
使用创新的多位移扩增(MDA)技术,从小样品中提供优化的全基因组扩增试剂(WGA)。50μl反应的典型DNA产量高达10μg,平均产物长度大于10kb(范围在2kb和100kb之间)。*的REPLI-g技术可从各种小型或珍贵样品中提供高度均一的WGA,包括纯化的基因组DNA,或直接来自新鲜或干燥的血液,新鲜或冷冻组织和细胞。

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 红荣微再(上海)生物工程技术有限公司 :1500 1904 520   Q:239 555 7778

QIAGEN REPLI-g Mini Kit 全基因组扩增试剂

用于从小或珍贵样品中进行高度均一的全基因组扩增

  • 易于扩增,产量高达10μg
  • 基因组基因座的无偏差扩增
  • 多位移放大(MDA)带来可靠的结果
  • 扩增的DNA非常适合大多数下游应用
  • 长期储存期间没有DNA降解的风险

       REPLI-g Mini Kit使用创新的多位移扩增(MDA)技术,从小样品中提供优化的全基因组扩增试剂(WGA)。50μl反应的典型DNA产量高达10μg,平均产物长度大于10kb(范围在2kb和100kb之间)。*的REPLI-g技术可从各种小型或珍贵样品中提供高度均一的WGA,包括纯化的基因组DNA,或直接来自新鲜或干燥的血液,口腔拭子,新鲜或冷冻组织和细胞。这种简单可靠的方法能够对基因组进行准确和无偏的扩增,并生成DNA,无需进一步纯化或定量即可应用于不需要标记的下游应用。与基于PCR的WGA技术相比,

性能

来自各种样品的高产量,适用于多种应用

      使用REPLI-g Mini Kit,可以使用各种临床和非临床研究样本,包括基因组DNA,新鲜或干燥的血液,新鲜或冷冻组织和细胞。每50μl反应的典型DNA产量始终达到10μg,而无论模板DNA的数量如何,通常都能获得均一的扩增DNA产量。从不同的模板浓度获得均匀的DNA产量始终是重要的,但对于高通量应用尤其重要,这需要随后的遗传分析,而无需额外测量或调整DNA浓度。

      REPLI-g扩增DNA的平均产物长度通常大于10kb,范围在2kb和100kb之间,使得能够进行下游应用,例如复杂的限制酶分析和长程PCR。REPLI-g扩增的DNA非常适用于基因分型应用,例如使用TaqMan®引物/探针组进行SNP基因分型,测序和STR /微卫星分析。

成功用于下一代测序

      许多出版物已经证明REPLI-g扩增DNA成功应用于下一代测序(NGS)应用,包括从肿瘤细胞的外显子组和全基因组测序,到宏基因组学研究,到单细胞分析(对于一系列近期出版物而言)在NGS中成功使用REPLI-g,请参阅我们的WGA资源页面)。由于使用全基因组扩增的DNA用于NGS和阵列应用已经引起争议,我们检测到可能影响使用扩增DNA用于这些下游应用的成功的潜在因素。我们确定输入材料的质量强烈影响下游NGS实验的成功。如果使用低质量DNA(例如,降解的DNA)或老化的组织材料,所得到的扩增的DNA可能不会给出可靠的结果(数据未显示)。然而,使用REPLI-g技术的WGA在完整细胞或未降解的纯化DNA上显示NGS结果与用纯化的gDNA获得的结果相当。基因组基因座序列的序列覆盖和比对比较表明WGA后的垃圾DNA水平小化,而扩增和基因组DNA的错误率在相似的百分比范围内。

高保真全基因组扩增

      REPLI-g技术在整个基因组中提供高度均一的DNA扩增。Phi29聚合酶可复制高达70kb而不与基因组DNA模板解离。与基于PCR的全基因组扩增(WGA)技术相比,Phi29聚合酶具有3'→5'核酸外切酶校正活性,并且在复制期间与Taq DNA聚合酶相比保持高达1000倍的保真度。试剂盒中提供的外切核酸酶抗性引物可确保高产量的DNA产物,WGA缓冲系统针对非常长的阅读长度和无偏的基因座表现进行了优化。

REPLI-g优于基于PCR的WGA方法

      传统的基因组DNA扩增方法包括创建EBV转化细胞系的耗时过程,然后使用随机或简并寡核苷酸引发的PCR进行全基因组扩增。此外,如其他供应商通常使用的基于PCR的方法(例如,DOP-PCR和PEP)可以产生非特异性扩增假象并且给出基因座的不*覆盖。在一些情况下,可能产生小于1kb长的DNA,其不能用于许多下游应用中。通常,由于使用低保真酶Taq,产生的DNA具有高得多的突变率DNA聚合酶,可导致容易出错的扩增,导致例如单碱基对突变,STR收缩和扩增。与这些缺点相反,REPLI-g在整个基因组中提供高度均一的扩增,在扩增过程中具有小的基因座偏差和小的突变率(参见“ 使用REPLI-g技术的高度代表性扩增 ”和“ *且准确的全基因组扩增 ”) )。

原理

      *的REPLI-g技术使用创新的高保真酶Phi 29聚合酶,使用多重置换扩增(MDA)和温和的碱性变性步骤扩增复杂的基因组DNA,以均匀地扩增基因组位点。REPLI-g Mini Kit的典型产量高达10μg,可以根据您的需要使用REPLI-g Midi Kit轻松按比例缩小,因为两种试剂盒都基于相同的方案并使用相同的反应体积。简单的反应设置和约15分钟的极低处理时间使得REPLI-g成为一种简单可靠的方法,当需要有限或珍贵样品的完整和无偏的轨迹表示时。

放大原理

      REPLI-g使用等温基因组扩增,称为多位移扩增(MDA),其涉及随机六聚体与变性DNA的结合,然后使用酶Phi29聚合酶在恒定温度下进行链置换合成。在用作模板的每个置换链上发生另外的引发事件,使得能够产生高产量的扩增DNA。Phi 29聚合酶是一种噬菌体衍生酶,是一种具有3'→5'主要核酸外切酶活性(校对活性)的DNA聚合酶,与Taq相比,其保真度高达1000倍。DNA聚合酶。在*,优化的REPLI-g缓冲系统的支持下,Phi 29聚合酶可轻松解决二级结构,如发夹环,从而防止聚合酶在扩增过程中滑脱,停止和解离。这使得能够产生高达100kb的DNA片段而没有序列偏。

DNA的碱性变性

      基因组DNA在用于酶扩增程序之前必须变性,这通常使用苛刻的方法完成,例如在升高的温度下孵育(加热孵育)或增加的pH(化学碱性孵育)。REPLI-g Midi Kit使用温和的碱性孵育,允许均匀的DNA变性,DNA碎片非常低或产生无碱基位点。这导致扩增的DNA具有非常高的完整性,并使扩增片段的长度大化,从而均匀地表示基因组基因座和序列。使用REPLI-g Mini Kit,可确保在后续下游应用中获得可靠的结果,而不会出现假阳性或阴性数据,这与其他使用热诱导变性的WGA技术不同,后者会损害模板DNA,从而导致偏向和代表性不足的位点

程序

简单,一管程序

      REPLI-g Mini Kit使用简单可靠的方法从少量分离的靶基因组DNA或直接从全血,干血卡,血沉棕黄层和组织培养细胞中获得准确的基因组扩增。加入裂解缓冲液,裂解样品材料并使DNA变性,然后进行短时间的孵育。中和后,加入预混合物(包括REPLI-g Mini DNA聚合酶),等温扩增反应在30℃下进行过夜。REPLI-g扩增的DNA可以在-20°C下长期保存,没有负面影响。

应用

REPLI-g扩增基因组可用于多种下游应用,包括:

  • 使用TaqMan®引物/探针组进行SNP基因分型
  • 基于qPCR和PCR的突变检测
  • 新一代测序
  • STR /微卫星分析
  • 桑格测序
  • RFLP和Southern印迹分析
  • 阵列技术,如比较基因组杂交 

QIAGEN REPLI-g Mini Kit 全基因组扩增试剂

QIAGEN REPLI-g Mini Kit产品订购信息

 品牌                         产品货号                 产品名称                

QIAGEN                    150023              REPLI-g Mini Kit (25)          

QIAGEN                    150025              REPLI-g Mini Kit (100)

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