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KAPA 人类基因组DNA定量及QC试剂盒

  • 型   号:KK4960
  • 价   格:

产品名称:KAPA 人类基因组DNA定量及QC试剂盒
产品货号:KK4960
产品规格:300反应

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产品介绍: 

  KAPA hgDNA定量&QC试剂盒,是基于SYBR Green I染料法优化的高质量qPCR检测试剂盒,包含KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix预先稀释的一系列DNA标准品,以及针对于人类基因组单拷贝的高度保守区域的不同位点所设计的引物预混液。最小片段所对应的引物,用于获得绝对定量的结果,而额外的引物,用于获得在DNA样本中可扩增模板量(质量高的核酸片段)的信息。这个试剂盒由此所产生的质量分数(即Q-ratios),可以用于预测文库的产量,或者对于如FFPE DNA这类样本质量变化很大的样本的工作流程进行调整。


产品名称:KAPA 人类基因组DNA定量及QC试剂盒

产品货号:KK4960


产品特点:

在单次检测中,同时评估样本量以及样本质量

可以将质量分数(Q-ratios)与测序相关指标相关联

高性能的KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix

预先稀释好的DNA标准品以及可以直接使用的引物

多功能、易于自动化的工作流程


产品原理:

一组DNA标准品,使用三对不同引物,用于产生(最多)三组标准曲线。这三对引物的扩增目标,位于某高度保守、单拷贝的人类基因组位点,其大小分别为41 bp, 129 bp以及305 bp。41 bp检测用于DNA样品的绝对定量。对于评估DNA质量,使用129 bp和/或305 bp引物预混液生成标准曲线并且检测样本。由于低质量的DNA样本的长片段扩增效率会大幅度降低,相对的DNA质量可以通过41 bp检测的浓度,对于129 bp或者305 bp检测的浓度进行均一化,或者在此DNA样本中可被扩增的物质的量来进行推测。这种通过标准化产生的质量分数(值介于0和1之间),可以用于指示DNA的质量,或者在此DNA样本中可被扩增的物质的量。


产品优势:

对于稀释后的DNA样本进行绝对定量

用附加的引物进行定量分析,获得的Q-ratio用于指示样本的质量1.png

使用预期:

文库的转化率,为在Illumina测序平台上进行靶向重测序而制备

分别从样本质量参差的80-100 ng FFPE DNA样本(橙色)和商用人类基因组DNA(灰色),使用KAPA LTP文库构建试剂盒来构建测序文库。FFPE DNA样本在用Covaris打断之前,用KAPA hgDNA定量&QC试剂盒进行检测,然后按照Q-ratios(DNA质量)沿X轴升序排列。Q-ratios如图中标注。片段化的DNA(平均大小在180 bp左右)在建库之前,用Qubit® HS dsDNA (Life Technologies) 进行定量;在连接接头、形成文库分子之后,使用基于qPCR的KAPA文库定量试剂盒进行定量。结果显示,FFPE样本的文库转化率(Conversion Rate,起始DNA分子转化成连接有接头的文库分子的百分比,%)明显低于高质量的DNA样本,使得FFPE样本的文库分子多样性受到限制,并且需要在文库扩增步骤中采取更多的循环数才能得到足够多的文库分子进行靶标捕获,从而使FFPE样本的文库的重复率(duplication rate) 更高,靶标覆盖率(target coverage)更低。


产品名称:KAPA 人类基因组DNA定量及QC试剂盒

产品货号:KK4960


产品订购信息

品牌     货号             名称                                   规格

KAPA  KK4960  KAPA hgDNA定量和质控试剂盒   300反应


关于公司:

Kapa Biosystems位于美国马萨诸塞州威尔明顿,是一家蛋白质工程专家及基因组学工具供应商,致力于研发、生产下一代测序(NGS)所需的生物酶及相关试剂,该公司基于直接分子进化平台开发的产品已被广泛用于DNA扩增、测序、基因组学研究、分子诊断等领域。


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