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Illumina chip-seq文库制备试剂盒48样本

  • 型   号:IP-202-1012
  • 价   格:

产品名称:Illumina chip-seq文库制备试剂盒48样本
产品货号:IP-202-1012
英文名称:TruSeq ChIP Library Preparation Kit - Set A
产品规格:48 Rxns

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产品简介:

  ChIP-Seq整合了染色质免疫共沉淀(ChIP)和高通量测序的技术优势,较ChIP-chip具有更大的开放性和精确性,可实现对任意物种的转录调控蛋白全基因组范围内DNA结合位点,为全面解析基因调控提供了新的支撑技术。ChIP-Seq首先利用抗体特异性地富集蛋白-DNA复合体,然后纯化DNA片段,并经末端修复、加A和加测序接头后,再经低循环数的PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳回收特定大小片段,完成测序文库制备的工作。构建好的文库经cBot扩增,用Illumina GAIIx进行测序,并通过生物信息学分析,鉴定出目的蛋白与基因组DNA结合的位点。


产品名称:Illumina chip-seq文库制备试剂盒48样本

产品货号:IP-202-1012 


产品特点:

产品优势:

精确性高:基因组结合位点定位精确性可达±50bp。

可靠性高:比ChIP-Chip具有更低的背景,无交叉杂交非特异性。

检测动力学范围广:定量检测不同结合强度转录因子/组蛋白的结合特异性。

全面的分析:可在全基因组范围内鉴定结合位点,无需候选序列信息。

更经济的分析:花费只有全基因组ChIP-Chip的1/30~1/10。

更低的起始样品量:仅需低至10~50ng的免疫沉淀DNA


技术参数:

QQ截图20220328143533.png


样本要求:

细胞样品:单次样品制备需大于2×107细胞。1%甲醛固定细胞后,PBS清洗细胞3次,离心收集细胞沉淀,液氮速冻,-80℃保存,干冰运输。

ChIP DNA样品:样品量大于50ng,样品浓度不低于10ng/μl,OD260/OD280为1.8~2.0。DNA片段大小在100~500bp之间,主带明显。样品最好进行过ChIP-PCR验证。样品溶于超纯水中,放于DNase-free的不黏管中,管口用封口膜封好,干冰运输。


相关知识:

Illumina二代测序技术,边合成边测序(SBS),是广泛采用的新一代测序(NGS)技术,负责产生世界上90%以上的测序数据。

Illumina的二代测序技术称为边合成边测序(Sequencing-by-Synthesis,简称SBS)。SBS主要包括碱基延伸、荧光激发及信号收集、剪切等3个步骤。这3个步骤可以重复,循环进行。每循环一次测定一个碱基。想测定多少个碱基(即读长),就循环多少次。测序循环次数可以在软件里设定。到底测序多长合适,要根据项目性质和需求来决定。大多数情况下,SR实验(单端测序)测定1x50个碱基,PE实验(双端测序)测定2x150个碱基。

1 碱基延伸

Illumina测序试剂里所使用的dNTP特色,它们同时具有两个修饰基团:一个荧光基团,一个可逆终止基团。可逆终止基团技术是Illumina二代测序的一大特色。它与桥式PCR技术一起,构成了Illumina二代测序的两大支柱,为稳定获得高质量的测序数据打下了坚实的基础。

2 信号采集

HiSeq系列测序仪具有红绿两根激光管,两个滤色片。它们两两组合,可以形成4种不同的激发波长,正好分别用于激发A、G、C、T 4种碱基。

Cluster上所标记的荧光基团在激光激发下产生的信号,可以用相机拍摄或者扫描的方式收集信号。扫描技术速度比较快,被X10系列采用。由于FC面积比较大,而且上表面和下表面要分别拍照,所以拍照过程相当耗时。对于经典的HiSeq 2000来说,一次测序循环所产生的荧光信号,需要大约40分钟的时间才能拍照收集完毕,时间比测序反应本身还要长。

3 剪切

荧光信号收集完毕后,关闭激光,用剪切剂去除测序引物的延伸产物上的碱基所标记的荧光基团和终止基团。两个修饰基团均被切除,一方面消去干扰荧光,一方面使链末端的碱基回复到自然的可延伸状态,为下一轮测序做好准备。

再重复合成、激发、收集等步骤,即可进行第二个碱基的测序。


产品订购信息  

品牌               货号                         名称                            规格

Illumina   IP-202-1012   TruSeq ChIP文库制备试剂盒     12 indexes, 48 Rxns

Illumina   IP-202-1024   TruSeq ChIP文库制备试剂盒     12 indexes, 48 Rxns


产品名称:Illumina chip-seq文库制备试剂盒48样本

产品货号:IP-202-1012


关于公司:

Illumina的目标是应用创新技术来分析遗传变异和功能,实现几年前甚至还无法想象的研究。我们的任务是提供创新、灵活、可扩展的解决方案以满足客户的需求。作为一家重视合作互动、快速交付解决方案和提供高质量水平的全球性公司,我们努力应对这一挑战。Illumina创新的测序和芯片技术正在推动生命科学研究、转化和消费者基因组学以及分子诊断中的进展。


红荣微再——助理分子诊断新未来


红荣微再作为RNA、NGS、ctDNA、qPCR的分子诊断专业供应商,以“传递科学价值,服务科学研究"为宗旨,努力为客户提供质量可靠、货美价优的分子诊断试剂耗材,与客户携手为中国分子诊断的发展而前行。

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